• <li id="mga46"></li>
  • <kbd id="mga46"><optgroup id="mga46"></optgroup></kbd>
  • <tbody id="mga46"></tbody>
  • <s id="mga46"><menu id="mga46"></menu></s>
    伯豪生物
    FFPE 空間轉錄組

    技術簡介

    空間轉錄組技術不僅可以提供研究對象的轉錄組等數據信息,同時還能定位其在組織中的空間位置,對癌癥發病機制、神經科學、發育生物學等眾多領域的研究來說都具有重要意義。目前該技術主要適用于新鮮冷凍組織樣本,臨床通常使用的 FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)樣本資源無法得到更加有效的應用。目前針對 FFPE 樣本的空間基因表達解決方案,可以從 FFPE 樣本中以高靈敏度和高特異性分析相關基因的空間表達信息。


    伯豪優勢

    1、打破對新鮮冰凍樣本的局限性,使臨床上大量的 FFPE 樣本得到更加有效的利用;

    2、RNA 模板連接(RTL) 探針集,具有高靈敏性和特異性,且探針集覆蓋了人和小鼠超過 18000 個基因;

    3、可以結合更廣泛的病理信息和預后信息,篩選生物標記物、進行回顧性和縱向研究,揭示更廣泛更深入的生物學問題。


    實驗流程

    111 (2)

    樣本要求

    1、滿足組織貼片實驗(不脫片);

    2、RNA 完整性:DV200>50%。


    分析流程

    通過生物信息分析直觀地展示 spot 分群和 spot 亞群在組織切片上的空間分布以及差異基因的空間分布。此外,還提供個性化需求分析等豐富的分析內容,包括單細胞數據與空轉數據的聯合分析等。

    222

    圖 基于 spot 的 cluster 分類(t-sne 圖)和 cluster 在切片上的分布


    3

    圖 海馬 marker HCPA 基因在切片上的表達分布(紅色區域表達量高)


    4

    圖 根據病理信息選擇特定區域進行分析(或者多個區域進行比較分析)


    5

    圖 不同細胞類群映射到切片上的結果





    參考文獻

    文章名稱:Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor antibody-producing plasma cells in renal cell cancer

    發表時間:2022 年 3 月

    發表期刊:Immunity

    影響因子:31.428

    發表單位:法國索邦大學 Cordeliers 研究院


    咨詢客服 - 伯豪生物





    <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <蜘蛛词>| <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链> <文本链>