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    伯豪生物
    單細胞核 RNA 測序

    技術簡介

    伯豪生物官網 www.ufomov.com 新消息 單細胞核轉錄組測序技術服務來了

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是從組織抽提細胞核,然后在單個細胞核水平上對轉錄組進行高通量測序分析的一項新技術,通過檢測單個細胞核的基因表達狀態,進而揭示細胞間的異質性。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    實驗流程

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序科研流程圖

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    冷凍樣本和難消化樣本的解決方案

    1、適用于凍存組織樣品;克服新鮮樣品時效性限制;

    2、適用于難以制備單細胞懸液的組織樣品;

    3、減少解離偏差,能更好地保留細胞類型多樣性;

    4、不需要酶促消化,真實反映細胞的組分。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    伯豪優勢

    1、高質量抽核:抽核經驗豐富,針對不同組織優化了解決方案;

    2、標準化內控:豐富的實操經驗構建了標準化的內控體系;

    3、流程化分析:完善的分析流程,準確快速解析單細胞核轉錄組數據;

    4、專業的團隊:專業的技術團隊具有多年項目方案設計、實驗操作、售后分析等經驗;

    5、全流程服務:提供組織抽核、單細胞核捕獲、反轉錄、建庫測序及數據分析的全套服務。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    樣本要求

    1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;

    2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;

    3、質量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;

    4、運輸方式:干冰運輸。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    應用領域

    冷凍樣本;通過消化難拿到高質量的單細胞懸液的組織類型。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    研究成果

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 1

    小鼠肝臟單細胞核

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 2


    人松果體單細胞核

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 3


    小鼠大腦皮層單細胞核

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 4

    小鼠心臟組織細胞核 RNA 質檢(RIN=8.9)

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 5

    PCR 驗證組織與細胞核、組織與消化細胞的差別(0 為相同)

    結論:

    小鼠大腦皮層,相比于消化細胞,細胞核的表達情況更接近于原始組織樣本。

    伯豪生物提供:單細胞核測序、單細胞核測序技術服務

    【單細胞轉錄組測序】VS【單細胞核轉錄組測序】結果對比

    1、隨著測序深度的不斷增加,單細胞核轉錄組測序(snRNA-seq)和單細胞轉錄組測序(scRNA-seq)得到的基因數相近。

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 6

    Single-cell DropSeq scDropSeq


    2、單細胞核轉錄組測序在細胞分群上與單細胞轉錄組測序沒有區別

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 7

    單細胞核數據分群結果                                     單細胞轉錄組數據分群結果

    3、單細胞核轉錄組測序可有效挖掘稀有細胞類型

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 8

    單細胞核轉錄組測序可以減少組織消化引起的偏差


    4、單細胞核轉錄組測序結果中發現較少壓力相關基因的表達

    伯豪生物單細胞核轉錄組測序數據圖 9

    參考文獻

    [1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita, et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

    [2] Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.

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