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    伯豪生物
    ceRNA 調控網絡

    Demo 結果

    DEMO 結果

    DEMO 結果 2

    結果解讀

    通過展示不同基因的 ceRNA 的調控機制,從中挖掘出實驗組與對照組不同類型的 ceRNA 機制,找到特異性的 ceRNA。線代表不同的 microRNA,藍色為 mRNA,紅色為 circRNA,綠色為 lncRNA。


    ceRNA 調控網絡介紹

    建立了一個計算的機制來使 circRNA(lncRNA) 作為 ceRNA 來保護 mRNA 不受 miRNA 的降解?;诨虻谋磉_值,通過回歸模型分析以及種子序列的匹配的方法,建立 microRNA 的海綿吸附作用的調控網絡。

    分析要求

    1、客戶需要提供 microRNA 表達數據(可選),circRNA(lncRNA) 表達;

    2、數據(必選),mRNA 表達數據(必選);

    3、每組數據 3 個或 3 個以上生物學重復。

    提供結果

    1、圖片文件(Network 圖),包括 png、PDF 格式;

    2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;

    3、文本文件:基因之間 ceRNA 調控關系,調控分數,circRNA(lncRNA)microRNA,mRNA 核心調控關系的排序。


    -END-



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