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    伯豪生物
    表達譜芯片

    應用領域

    基因表達譜芯片可使科研工作者實現在 mRNA 水平上同時平行研究成百上千乃至上萬條基因的表達關系。它的主要用途是用于大規模分析一定的生物對象在特定生物過程中(如疾病、發育、分化、凋亡等)基因表達變化的信息。

    伯豪優勢

    成熟的服務平臺:穩定而系統的芯片實驗解決方案,可為客戶提供總 RNA 抽提、樣品質檢、RNA 標記、雜交、洗脫、圖像掃描、數據分析等一系列服務。

    專業的實驗人員:從 RNA 抽提到芯片雜交均配備有專業的實驗人員,具有豐富的芯片實驗操作經驗,遵循嚴格的質控標準,層層把關確保高質量完成實驗。

    強大的分析團隊:實戰經驗豐富的分析團隊,除能快速完成基礎分析外,還能根據客戶需求完成個性化分析,提供各類高大上的圖表。

    穩健的支持團隊:一對一服務,為您解決項目全過程中的各類問題,包括但不限于項目方案制定、樣本收集、數據結果解讀、數據深度挖掘及文章發表支持等。


    產品簡介

    Agilent  表達譜芯片

    Agilent 表達譜芯片及規格圖


    Affymetrix  表達譜芯片

    Affymetrix 表達譜芯片服務

    產品特點

    Agilent  表達譜芯片

    基于非接觸式噴點的寡核苷酸原位合成技術:此種方法可以隨時修改芯片的設計,為客戶提供新的芯片和價格合理的定制服務。

    全程質控:每個堿基的合成都由質量控制系統進行實時監測,消除堿基樣點丟失及偏離現象。

    高靈敏度:合成探針長達 60-mer,達到檢測靈敏度與特異性的平衡。

    優化的探針設計:針對每個序列設計一個探針,有利于簡化實驗數據的處理。


    Affymetrix  表達譜芯片

    芯片設計:采用光蝕刻原位合成技術合成芯片;

    靈敏度高:25mer 長度的短探針設計,靈敏度更高;

    重復性高,穩定性好:針對每個轉錄本設置多組探針,保證信息完整性及實驗穩定性。

    通用性:Agilent 所有芯片相關產品都采用了 1″×3″工業標準的芯片。

    樣本要求

    Agilent  表達譜芯片

    Agilent 表達譜芯片樣本要求


    Affymetrix  表達譜芯片

    Affymetrix 表達譜芯片樣本要求

    分析流程

    Agilent  表達譜芯片

    Agilent 表達譜芯片分析流程


    Affymetrix  表達譜芯片

    Affymetrix 表達譜芯片分析流程

    案例展示

    Agilent  表達譜芯片

    案例一

    研究背景

    腫瘤轉移是腫瘤致死的主要原因之一。腫瘤的轉移包括腫瘤細胞的侵襲、存活、沉降和定植等一系列過程。原發部位和遠端轉移位點的微環境是腫瘤細胞散播和定植的重要驅動力。原發部位腫瘤可以調動和招募骨髓來源的細胞形成轉移前微環境,為腫瘤細胞轉移至遠端部位提供趨化因子、生長因子和黏附因子,進而加速腫瘤轉移。因此識別腫瘤馴化細胞,明確其功能是揭示腫瘤發生和轉移的關鍵問題。

    研究思路

    Agilent 表達譜芯片研究思路

    研究成果

    本研究闡明了腫瘤馴化 B 細胞產生病理性抗體 IgG 介導的體液免疫在創造淋巴結轉移前微環境形成及淋巴結轉移中的重要功能。B 細胞產生的病理性抗體可以與腫瘤細胞膜表面糖基化的抗原 HSPA4 結合,調控相關基因的表達,激活下游的 NF-κ B 通路,進而促進淋巴結轉移。其重要意義是發現了一個潛在的預后指標腫瘤抗原 HSPA4 及其病理性抗體 IgG,對乳腺癌病人的預測和治療提供了新的靶點。

    Agilent 表達譜芯片研究結果分享

    參考文獻

    Gu Yan, Liu Yanfang, Fu Li et al. Tumor-educated Bcells selectively promote breast cancer lymph node metastasis by HSPA4-targeting IgG.[J] .Nat. Med., 2019, 25: 312-322.


    案例二

    研究背景

    骨關節炎(Osteoarthritis,OA) 是常見的關節退行性疾病,具有很高的患病率和致殘率。目前我國 OA 患者超過 1 億,占全世界 OA 患者的 10% 以上,OA 已成為我國老年人群致殘的主要疾病,給患者和社會都帶來了沉重的負擔。目前的研究認為 OA 的發展離不開軟骨下骨的病變,但具體的致病機制仍不清楚。

    研究成果

    在 OA 模型小鼠中激活軟骨下骨成骨前體細胞雷帕霉素靶蛋白復合物 1(mTORC1)通路,能夠導致異常軟骨下骨形成,軟骨下骨硬化對關節軟骨完整性幾乎沒有影響,但是會加速創傷后的小鼠 OA 的形成。相反,通過破壞 Raptor 抑制 mTORC1 通路,就可以減少軟骨下骨形成和軟骨退化,同時也減緩了輕創傷后小鼠 OA 的形成過程。進一步研究表明,mTORC1 的激活會促進軟骨下骨成骨前體細胞的增殖和 CXCL12 的分泌,而 CXCL12 可以激活免疫抗體從而有效地減少軟骨退化減輕小鼠 OA 病癥。

    Agilent 表達譜芯片案例二研究結果分享

    參考文獻

    Lin Chuangxin, Liu Liangliang, Zeng Chun et al. Activation of mTORC1 in subchondral bone preosteoblasts promotes osteoarthritis by stimulating bone sclerosis and secretion of CXCL12.[J] .Bone Res, 2019, 7:5.



    Affymetrix  表達譜芯片

    案例三

    研究背景 3

    鼻咽癌是我國常見的頭頸腫瘤,其中以華南地區較多。約 70% 的鼻咽癌患者在就診時已經處于局部區域晚期(無遠處轉移),嚴重威脅著我國人民的生命健康。目前局部區域晚期鼻咽癌患者仍有 20-30% 的在治療后會出現遠處轉移,成為治療失敗的主要原因。采取傳統的腫瘤臨床 N 分期方法,預測遠處轉移的準確性僅為 57% 左右;并且,相同分期的患者接受同樣的治療后常常出現不同的生存結局,臨床上缺乏有效的標志物指導鼻咽癌患者的治療方案選擇。

    研究思路 3

    Affymetrix 表達譜芯片案例一研究思路

    研究成果 3

    中山大學腫瘤防治中心馬駿教授團隊開展了現今國際大規模的鼻咽癌分子標志物研究,團隊通過 Affymetrix Human Gene 2.0 ST 芯片對接受治療后有無出現遠處轉移的鼻咽癌組織(FFPE 樣本)全基因組表達水平進行對比分析,從數萬個基因中初步鎖定 137 個差異表達基因,再用回歸分類器的統計方法從 410 例患者中篩選 13 個遠處轉移相關的基因構建分子標簽,將病人分為高風險組和低風險組。結果顯示,高風險組患者 5 年遠處轉移率高達 37%,低風險組則僅為 9%。本項研究還發現,利用這組分子標簽可以區分鼻咽癌患者同期化療獲益人群。與鼻咽癌傳統預后指標相比效果,將分子標簽與 N 分期等臨床指標相結合構建鼻咽癌遠處轉移線列圖,能夠將預測準確性由 57% 提高至 75%。

    Affymetrix 表達譜芯片案例一研究結果

    參考文獻 3

    Tang Xin-Ran, Li Ying-Qin, Liang Shao-Bo et al. Development and validation of a gene expression-based signature to predict distant metastasis in locoregionally advanced nasopharyngeal carcinoma: aretrospective, multicentre, cohort study.[J] .Lancet Oncol., 2018, 19: 382-393.


    案例四

    研究背景 4

    必需氨基酸(甲硫氨酸、纈氨酸、賴氨酸、異亮氨酸、苯丙氨酸、亮氨 酸、蘇氨酸、組氨酸)不僅為蛋白質、脂類、核酸等生物大分子的合成提供“原料”,而且還能夠作為信號分子誘導 mTOR 通路的激活。相對正常細胞來講,腫瘤細胞大量吸收葡萄糖和谷氨酰胺,同時也需要由谷氨酰胺之外的其他氨基酸提供碳源和氮源,其中關鍵的就是人體不能合成、必須依賴外源攝取的必需氨基酸。腫瘤細胞常常表現出大量吸收必需氨基酸這一重要特征,然而如何快速轉運必需氨基酸以及必需氨基酸代謝如何促進腫瘤惡化的機制尚不清楚。

    研究成果 4

    武漢大學醫學研究院卿國良教授課題組研究人員首先證明了癌蛋白 MYC 是激活腫瘤細胞攝取必需氨基酸的關鍵性轉錄調控因子。進一步研究發現,MYC 通過直接激活的方式調控了 SLC7A5 和 SLC43A1 的表達,并形成了 MYC-SLC7A5/SLC43A1 正反饋環路,增強腫瘤細胞對必需氨基酸的攝取,抑制 GCN2-eIF2α-ATF4 應激通路,繼而選擇性激活 Myc、Bcl2、Cyclin D1 等關鍵促癌基因的蛋白質翻譯,促進腫瘤的惡性發展。該研究報道了 Myc-SLC7A5/SLC43A1 正反饋環路通過重編程必需氨基酸代謝從而促腫瘤惡性發展的分子機制,不但揭示了代謝異常促腫瘤發生發展的新機制,而且為 MYC 高表達腫瘤病人的治療提供了潛在靶點。

    Affymetrix 表達譜芯片案例二研究結果

    參考文獻

    Yue Ming, Jiang Jue, Gao Peng et al. Oncogenic MYC Activates a Feedforward Regulatory Loop Promoting Essential Amino Acid Metabolism and Tumorigenesis.[J] .Cell Rep, 2017, 21: 3819-3832.

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